咖啡豆在烘焙过后会产生出相对于体积三倍的二氧化碳，因此，咖啡豆的包装最主要除了避免与空气接触氧化话，还有需要处理咖啡豆产生的二氧化碳。为了达到最佳的保存效果，人们先后对咖啡豆的包装进行了不同的尝试。

柔性的非气密性包装：这是最经济的一种，通常由地方小烘焙厂采用，因为他们能保证迅速地供货，咖啡豆可及时地消耗完。采用这种包装方式的咖啡豆只能短期保存，一般不超过一周。

气密性包装：主要以小袋和罐装为主，咖啡装好后抽真空并密封。由于烘焙会产生二氧化碳，此方法只能在咖啡放置一段时间脱气后方能进行，需几天存储期。由于贮存期间不需要与空气隔开，因此成本较低。采用这样的包装方式下的咖啡应该在10周内用完

真空包装：包装容器（罐、铝箔袋、胶袋）在填充咖啡后，将容器内的空气抽出。虽然名为真空，但事实上顶多去除了90%的空气，且咖啡粉的面积比咖啡豆的表面积大，即使是剩余的一点空气，也很容易与粉末结合而影响风味。

瓦斯填充包装：在金属袋上设计一个针孔，在填充咖啡后，将非活性的氮气灌入，把袋内的二氧化碳从针孔挤压出去。这种方式比较普及，但所有的气体被排出后，氧气就无声无息地从针孔反钻入袋内了。

瓦斯吸着剂包装：将由脱氧素、脱碳素所制成的吸着剂放入包装袋中，包装内的空气可轻易地吸收，并且咖啡所产生的碳酸气亦能吸入，但咖啡的香气也会被吸走是其缺点。

单向阀包装：1970年意大利人路易吉·戈格里奥（Luigi Goglio）发明单向排气阀包装袋。可以用各种密封的容器，烘焙后的咖啡放进特制的带单向阀的密闭容器中，这种单向阀只能让气体排出而不会流入，保证了咖啡与外界空气的绝缘和所产生的二氧化碳及时排出。不需要单独贮存阶段，但由于有放气过程，香气会有一定损失。该方式可避免异味的形成，但无法完全阻止香气的损失。这是目前咖啡豆最为普及的包装方式。

加压包装：这是种昂贵的保存方式，但能保存咖啡达两年之久。体积大小取决于用于类型，家庭还是咖啡店。在烘焙几分钟后，咖啡就能被真空包装。加入一些惰性气体（氮气）后，包装内保持合适的压力，咖啡豆在加压下保存，使香气留在脂肪上，由此改善了饮料的香味。

不锈钢压力包装：意大利魔力咖啡公司（Caff  Molianri SPA）与意大利莫德纳大学化学系共同开发了一项新的咖啡豆包装技术，这就是“不锈钢压力包装技术”。他们使用一个比较厚的不锈钢包装桶，在咖啡豆烘焙完成后，完全晾凉后，装入包装桶，然后将包装桶密封起来。咖啡豆释放出来的二氧化碳气体越来越多，包装桶内的压力将越来越大，并最终与咖啡豆内部的内力达到平衡。其结果就是咖啡豆不再向外释放二氧化碳，而咖啡豆里的“香味”成分也就还保留在咖啡豆内。这种包装方式可以将咖啡豆保存3年之久。